كانت البداية الاولى لإنشاء متحف قلعة زبيد في موقع الدبايه القديمة القبة والقبو الملاصق للمتحف من الجانب الشرقي ( مخازن متحف قلعة زبيد في الوقت الحالي ) كان عبارة عن عرض متواضع لبعض اللقى الاثرية الناتجة عن الحفريات والتنقيبات الاثرية في قلعة زبيد وما حولها وهذه الدبايه انت النواه الاولى لإنشاء متحف قلعة زبيد في عام 1986 م , وفي عام 1996 وبالتعاون بين الهيئة العامة للأثار والمتاحف والبعثة الاثرية الكندية العاملة في مدينة زبيد تم اختيار( مخازن الغلال ) الواقع في الجزء الجنوبي من سور قلعة زبيد لتطويره وإعداده وتأهيله كمتحف إقليمي بمدينة زبيد بعد تجهيز بعض الفترينات الخشبية . وفي عام 1997 م وبدعم من المجلس المحلي بمحافظة الحديدة تم تزويد متحف قلعة زبيد بمجموعة من فترينات العرض المتحفي الخشبية ( قائمة – حائطية ). وفي عام 2004 م وبالتعاون بين الهيئة العامة للأثار والمتاحف والمركز الثقافي التابع للسفارة اليابانية بصنعاء تم تزويد متحف قلعة زبيد ومتحف الموروث الشعبي بمجموعة من فترينات العرض المتحفي الزجاجية ( قائمة – حائطية ) وكذا إعادة اعمال التمديدات الكهربائية لكل من متحف قلعة زبيد ومتحف الموروث الشعبي الواقع في الجزء الغربي من القلعة , وفي عام 2005 م تم استحداث مركز المعلومات في الجزء الجنوبي الشرقي من قلعة زبيد ويضم المركز مجموعة من الصور الفوتوغرافية للحفريات والتنقيبات الاثرية داخل قلعة زبيد ومسجد الاشاعر ومجموعة من فترينات العرض المتحفي التي تضم بعض الفخاريات الناتجة عن الحفريات الأثرية وفترينة خاصة بالأبحاث الاثرية والمقالات في بعض المجلات المتخصصة في الجامعات الكندية وتقارير البعثة الكندية الخاصة بمدينة زبيد .

ولا ننسى هناء الدعم الكبير الذي حضي بها مكتب الهيئة العامة للآثار والمتاحف وخاصة متحف قلعة زبيد التاريخية من قبل الصندوق الاجتماعي للتنمية منها مثلاً مشروع ترميم وتحسين الواجهة 

الشمالية لقلعة زبيد في عام  2005م وكذا مشروع تأهيل متحف قلعة زبيد بمركز المعلومات في الجانب الشمالي للقلعة في العام 2006 م ( المكتب الحالي لهيئة المدن التاريخية فرع زبيد ) , وفي 11/2/ 2021 تم تدشين مشروع إنقاذ وترميم متحف قلعة زبيد التاريخية – الممول من الاتحاد الاوروبي واليونسكو  تحت إشراف وتنفيذ الصندوق الاجتماعي للتنمية – فرع الحديدة ­– بالشركة مع الهيئة العامة للأثار والمتاحف وينقصنا بعض التجهيزات كالإضاءة الكهربائية داخل المتحف التي تكرم الأخ رئيس الهيئة العامة للأثار والمتاحف بتوفير الطاقة الشمسية وتزويد المتحف بعدد من المرواح الكهربائية في شهر إبريل 2024 م وفي شهر مايو من نفس العام تم إعادة فتح المتحف رسيماً أمام الزوار بعد أن اغلق لأكثر من سبع سنوات